I Vedaernes gamle videnskabelige tradition siges følgende om Agnihotra: Netop på tidspunktet for morgen-Agnihotra tiltrækkes alle elektriciteter, energier og ætere til pyramiden i dens form. Ved solnedgang stødes disse energier ud i samme form. Denne strøm af energier ved solopgang skaber stærke rensende virkninger på alle niveauer, hvor den rører Jorden. Agnihotra forstærker disse rensende virkninger på følgende måde: Denne strøm af subtile energier bærer musik med sig. Morgen-Agnihotra-mantraet er essensen af denne musik. Det er den kvintessentielle lyd af denne strøm. Hvis du derefter udtaler disse mantraer og lægger risen blandet med ghee i en kobberpyramide af fast størrelse og form, skabes der en kanal gennem hele atmosfæren, og Prana – livsenergi – renses. Enorme mængder energi samles omkring Agnihotra-kobberpyramiden netop på Agnihotra-tidspunktet. Pyramiden er generatoren, ilden er turbinen. Et magnetisk felt skabes, som neutraliserer negative energier og forstærker positive energier. Når Agnihotra udføres, samler Agnihotra-røgen partikler af skadelig stråling i atmosfæren og neutraliserer på et meget subtilt niveau deres radioaktive virkning. Intet ødelægges, det ændres blot. Meget helbredende energi udstråler fra Agnihotra-pyramiden. Et aura-energifelt skabes omkring planter under Agnihotra. Således bliver planter stærkere og mere sygdomsresistente. Når flammen slukkes, låses energien i den resulterende aske. Denne aske bruges til at fremstille forskellige folkemedikamenter. Derfor skaber du ved regelmæssig udførelse af morgen- og aften-Agnihotra et positivt energimønster på alle niveauer.

Hvordan opstår disse virkninger? For nylig udføres eller planlægges flere studier for bedre at forstå, hvordan disse gavnlige virkninger af Agnihotra og Homa-terapi på hele miljøet opstår.

Fra en amerikansk videnskabsmand lærte vi følgende: „Pat Flanagan foreslog en fysisk forklaring på Agnihotra-røgens afforurenende virkning og påpegede, at dens kolloidale molekyler af ghee og kogødning kunne chelaterende tiltrække og gribe forurenende stoffer i luften, på samme måde som vand renses ved flokkulering. De opfangede molekyler, tilføjede han, ville alkalisere jorden, når de lægger sig på jorden; og hvis de kom i kontakt med en plante, ville de klæbe til bladene og fungere som et bladnæringsstof med langsom frigivelse. Fysisk set ville røgen være elektrisk ladet på grund af ghee og gødning.” (Citat fra Tompkins/Bird, Secrets of the Soil, New York 1989)

Moderne medicin er stadig i begyndelsen af at undersøge disse forslag. Mere om dette kan findes under “Videnskab”. Vedaernes traditionelle viden har mange forslag til, hvilke virkninger Agnihotra har på forskellige områder.