Ve starověké vědecké tradici Véd se o Agnihotře říká následující: Právě v době ranní Agnihotry jsou všechny elektricity, energie a étery přitahovány k pyramidě v jejím tvaru. Při západu slunce jsou tyto energie vytlačovány ve stejném tvaru. Tento proud energií při východu slunce vytváří silné očistné účinky na všech úrovních, kdekoli se dotýká Země. Agnihotra zesiluje tyto očistné účinky následujícím způsobem: Tento proud subtilních energií s sebou nese hudbu. Ranní Agnihotra mantra je esencí této hudby. Je to kvintesenciální zvuk tohoto proudu. Pokud pak vyslovíte tyto mantry a vložíte rýži smíchanou s ghí do měděné pyramidy pevné velikosti a tvaru, vytvoří se kanál celou atmosférou a Prána – životní energie – je očištěna. Obrovské množství energie se shromažďuje kolem měděné pyramidy Agnihotry právě v době Agnihotry. Pyramida je generátor, oheň je turbína. Vytváří se magnetické pole, které neutralizuje negativní energie a posiluje pozitivní energie. Když se provádí Agnihotra, kouř Agnihotry sbírá částice škodlivého záření v atmosféře a na velmi subtilní úrovni neutralizuje jejich radioaktivní účinek. Nic není zničeno, pouze změněno. Z pyramidy Agnihotry vyzařuje mnoho léčivé energie. Kolem rostlin se během Agnihotry vytváří aurické energetické pole. Rostliny se tak stávají silnějšími a odolnějšími vůči nemocem. Když plamen zhasne, energie se uzamkne ve výsledném popelu. Tento popel se používá k přípravě různých lidových léků. Proto pravidelným prováděním ranní a večerní Agnihotry vytváříte pozitivní energetický vzorec na všech úrovních.
Jak tyto účinky vznikají? V poslední době se provádí nebo plánuje více studií, aby se lépe pochopilo, jak tyto příznivé účinky Agnihotry a Homa terapie na celé životní prostředí vznikají.
Od jednoho amerického vědce jsme se dozvěděli následující: „Pat Flanagan navrhl fyzikální vysvětlení dekontaminačního účinku kouře Agnihotry a poukázal na to, že jeho koloidní molekuly ghí a kravského hnoje by mohly chelatačně přitahovat a zachycovat znečišťující látky ve vzduchu, podobně jako se voda čistí flokulací. Zachycené molekuly, dodal, by po usazení na zemi alkalizovaly půdu; a pokud by přišly do kontaktu s rostlinou, přilnuly by k listům a působily by jako listová výživa s postupným uvolňováním. Fyzikálně by byl kouř kvůli ghí a hnoji elektricky nabitý.“ (Citát z Tompkins/Bird, Secrets of the Soil, New York 1989)
Moderní medicína je stále na začátku zkoumání těchto tvrzení. Více o tom lze nalézt pod „Věda“. Tradiční znalosti Véd obsahují mnoho tvrzení o tom, jaké účinky má Agnihotra v různých oblastech.